我有一个需要 jsonify 的对象列表。我查看了 flask jsonify 文档,但我就是不明白。
我的类(class)有几个 inst-var,每个都是一个字符串:gene_id
、gene_symbol
、p_value
。我需要做什么才能将其序列化为 JSON?
我的幼稚代码:
jsonify(eqtls = my_list_of_eqtls)
结果:
TypeError: <__main__.EqtlByGene object at 0x1073ff790> is not JSON serializable
大概我必须告诉jsonify如何序列化一个EqtlByGene
,但是我找不到一个例子来说明如何序列化一个类的实例。
我一直在尝试按照下面显示的一些建议来创建我自己的 JSONEncoder 子类。我的代码现在是:
class EqtlByGene(Resource):
def __init__(self, gene_id, gene_symbol, p_value):
self.gene_id = gene_id
self.gene_symbol = gene_symbol
self.p_value = p_value
class EqtlJSONEncoder(JSONEncoder):
def default(self, obj):
if isinstance(obj, EqtlByGene):
return {
'gene_id' : obj.gene_id,
'gene_symbol' : obj.gene_symbol,
'p_value' : obj.p_value
}
return super(EqtlJSONEncoder, self).default(obj)
class EqtlByGeneList(Resource):
def get(self):
eqtl1 = EqtlByGene(1, 'EGFR', 0.1)
eqtl2 = EqtlByGene(2, 'PTEN', 0.2)
eqtls = [eqtl1, eqtl2]
return jsonify(eqtls_by_gene = eqtls)
api.add_resource(EqtlByGeneList, '/eqtl/eqtlsbygene')
app.json_encoder(EqtlJSONEncoder)
if __name__ == '__main__':
app.run(debug=True)
当我尝试通过 curl 访问它时,我得到:
TypeError(repr(o) + " is not JSON serializable")
最佳答案
给你的 EqltByGene
一个额外的返回字典的方法:
class EqltByGene(object):
#
def serialize(self):
return {
'gene_id': self.gene_id,
'gene_symbol': self.gene_symbol,
'p_value': self.p_value,
}
然后使用列表推导将您的对象列表转换为可序列化值的列表:
jsonify(eqtls=[e.serialize() for e in my_list_of_eqtls])
替代方法是为 json.dumps()
函数编写一个钩子(Hook)函数,但由于您的结构相当简单,因此列表推导和自定义方法方法更简单。
你也可以是真正的冒险家和子类 flask.json.JSONEncoder
;给它一个 default()
方法,将你的 EqltByGene()
实例变成一个可序列化的值:
from flask.json import JSONEncoder
class MyJSONEncoder(JSONEncoder):
def default(self, obj):
if isinstance(obj, EqltByGene):
return {
'gene_id': obj.gene_id,
'gene_symbol': obj.gene_symbol,
'p_value': obj.p_value,
}
return super(MyJSONEncoder, self).default(obj)
并将其分配给 app.json_encoder
attribute :
app = Flask(__name__)
app.json_encoder = MyJSONEncoder
只需将您的列表直接传递给 jsonify()
:
return jsonify(my_list_of_eqtls)
您还可以查看 Marshmallow project用于将对象序列化和反序列化为易于适应 JSON 和其他此类格式的 Python 原语的更成熟和灵活的项目;例如:
from marshmallow import Schema, fields
class EqltByGeneSchema(Schema):
gene_id = fields.Integer()
gene_symbol = fields.String()
p_value = fields.Float()
然后使用
jsonify(eqlts=EqltByGeneSchema().dump(my_list_of_eqtls, many=True)
生成 JSON 输出。相同的模式可用于验证传入的 JSON 数据和(使用 appropriate extra methods ),用于再次生成 EqltByGene
实例。
https://stackoverflow.com/questions/21411497/